Caracterización de secuencias genéticas CRISPR en microorganismos asociados a infecciones en camarón (Litopenaeus vannamei)

• Ángel Parra https://orcid.org/0000-0001-5908-8092
• Carla Lossada Laboratorio de Caracterización Molecular y Biomolecular – Centro de Investigación y Tecnología de los Materiales – Instituto Venezolano de Investigación Científica - Zulia. Sección 526. Maracaibo, Venezuela https://orcid.org/0000-0003-3346-7101
• Aleivi Pérez Departamento de Biología, Facultad Experimental de Ciencias, La Universidad del Zulia. Laboratorio de Microbiología General. Venezuela. https://orcid.org/0000-0003-2615-8917
• Johnny Navarrete Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí Manuel Félix López, Sitio El Limón, Campus Politécnico Calceta, Manabí, Ecuador. https://orcid.org/0000-0002-5448-2506
• Lenin González Departamento de Biología, Facultad Experimental de Ciencias. La Universidad del Zulia. Laboratorio de Genética y Biología Molecular. Laboratorio de Citogenética https://orcid.org/0000-0003-0023-7342

Resumen

En el cultivo del camarón, la familia de las proteobacterias Vibrionaceae, especialmente las especies del género Vibrio, representan uno de los principales responsables de las infecciones en la producción de camarones (Litopenaeus vannamei), generando grandes pérdidas a esta industria. La fagoterapia surge como una alternativa novedosa para el control de dichas infecciones en sustitución al uso de antibióticos, gracias a la actividad inhibitoria especifica de estos virus. Sin embargo, es necesario tomar en cuenta la presencia en procariotas de secuencias genéticas denominadas repeticiones palindrómicas cortas agrupadas y regularmente interespaciadas (CRISPR) que actúan como sistema inmune contra la invasión de elementos genéticos móviles externos como fagos o plásmidos. Dadas sus características, el sistema CRISPR/Cas se emplea como herramienta para la edición de genes. En este estudio se presenta el análisis comparativo de 7 loci CRISPR encontrados en 5 secuencias de genomas completos, disponibles en la base de datos del NCBI/GenBank, para determinar la potencialidad del empleo de la estrategia fágica en camaronicultura. Los sistemas CRISPR correspondieron a los tipos I-E, I-F y III-D. El 53 % de los espaciadores (75/142) presentó homología con plásmidos, mientras que el 47 % restante (67/142) mostró homología con bacteriófagos, en su mayoría virus no típicos infectivos de Vibrio. Se propone el uso de la fagoterapia como tratamiento de infecciones causadas por miembros de la familia Vibrionaceae en cultivos de camarón debido a la baja ocurrencia de sistemas CRISPR en las especies estudiadas y la baja inmunidad a sus fagos, asegurando así una mayor sensibilidad.

Citas

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