Caracterização de sequências genéticas CRISPR em microrganismos associados a infecções em camarões (Litopenaeus vannamei)

• Ángel Parra https://orcid.org/0000-0001-5908-8092
• Carla Lossada Laboratorio de Caracterización Molecular y Biomolecular – Centro de Investigación y Tecnología de los Materiales – Instituto Venezolano de Investigación Científica - Zulia. Sección 526. Maracaibo, Venezuela https://orcid.org/0000-0003-3346-7101
• Aleivi Pérez Departamento de Biología, Facultad Experimental de Ciencias, La Universidad del Zulia. Laboratorio de Microbiología General. Venezuela. https://orcid.org/0000-0003-2615-8917
• Johnny Navarrete Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí Manuel Félix López, Sitio El Limón, Campus Politécnico Calceta, Manabí, Ecuador. https://orcid.org/0000-0002-5448-2506
• Lenin González Departamento de Biología, Facultad Experimental de Ciencias. La Universidad del Zulia. Laboratorio de Genética y Biología Molecular. Laboratorio de Citogenética https://orcid.org/0000-0003-0023-7342

Resumo

Na criação de camarões, a família das proteobacteria Vibrionaceae, especialmente as espécies agrupadas no género Vibrio, representam uma das principais responsáveis ​​por infecções na produção de camarão (Litopenaeus vannamei), gerando grandes prejuízos a esta indústria. A terapia fágica surge como uma nova alternativa para o controle dessas infecções em substituição ao uso de antibióticos, graças à atividade inibitória específica desses vírus. No entanto, é necessário levar em consideração a presença em procariotos de sequências genéticas denominadas repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas (CRISPR) que atuam como um sistema imunológico contra a invasão de elementos genéticos móveis externos, como fagos ou plasmídeos. Pelas suas características, o sistema CRISPR / Cas é utilizado como ferramenta de edição de genes. Este estudo apresenta a análise comparativa de 7 locos CRISPR encontrados em 5 sequências de genomas completos, disponíveis no banco de dados do NCBI/GenBank, para determinar o potencial de utilização da estratégia de fagos na carcinicultura. Os sistemas CRISPR corresponderam aos tipos I-E, I-F e III-D. 53 % dos espaçadores (75/142) mostraram homologia com plasmídeos, enquanto os restantes 47 % (67/142) mostraram homologia com bacteriófagos, principalmente vírus infecciosos Vibrio não típicos. A utilização da terapia fágica é proposta como tratamento para infecções causadas por membros da família Vibrionaceae em cultivo de camarão devido à baixa ocorrência de sistemas CRISPR nas espécies estudadas e à baixa imunidade aos seus fagos, garantindo assim maior sensibilidade.

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